大型研究及大量临床经验都证实子宫颈癌疫苗是安全的。常见的副作用与其他一般疫苗相似，包括注射位置红肿和疼痛，发烧和头痛。子宫颈癌疫苗有6年临床数据，暂未见有与疫苗相关的严重副作用，所以疫苗的安全性是可靠的。
早前进行的一项调查，发现受访妇女在决定注射子宫颈癌预防疫苗时所考虑的因素是1）安全性2）效用3）费用。
现时的临床数据和研究都显示，市面上的疫苗在前两项的表现都非常理想，因此市民如果经济能力许可，加上医生指导下，都可以考虑注射，为自己及女儿的健康提供多一份保障。展望未来，子宫颈癌疫苗的研究方向将会是口服疫苗和更加方便储存方法等问题，如果研究成功，将会令全球更多妇女受惠，减少受这个[沉默的杀手]所威胁。
